Doctorant à l’ILL : Interactions gouttelettes lipidiques–capside de la dengue par neutrons (F/H)

Titre de Thèse : Les gouttelettes lipidiques comme modèles biophysiques pour comprendre la réplication virale : mécanismes moléculaires de la liaison de la protéine de capside du virus de la dengue étudiés par diffusion neutronique (LYON)

Vous rejoindrez le groupe Structures à grande échelle de l'Institut Laue-Langevin (ILL), le centre de recherche neutronique le plus avancé au monde, situé à Grenoble. L'ILL offre à la communauté scientifique l'accès au flux neutronique continu le plus intense au monde et héberge une large gamme d'instruments destinés à la biologie structurale, à la matière molle et à la science des surfaces, notamment des instruments de diffusion neutronique à petits angles (SANS/USANS) (D11, D22, D33) et des réflectomètres neutroniques (D17, Figaro). Ces instruments exploitent la variation de contraste, une technique neutronique puissante, permettant de résoudre des structures à l'échelle moléculaire au niveau d'interfaces complexes, autrement invisibles pour d'autres sondes.

L'objectif du projet de doctorat est de comprendre les mécanismes moléculaires par lesquels les protéines de la capside du virus de la dengue (DENV-C) se lient à la surface des gouttelettes lipidiques (LD), un processus essentiel à la réplication virale. La dengue infecte plus de 400 millions de personnes chaque année dans 100 pays, mais les interactions moléculaires qui sous-tendent le recrutement des DENV-C vers les LD, médiées par la protéine Plin3 à la surface des LD, restent encore mal comprises. La nouveauté du projet réside dans l'utilisation de techniques quantitatives de diffusion neutronique (SANS/USANS et réflectivité neutronique avec variation de contraste) pour étudier directement la structure et les interactions de DENV-C et de ses analogues peptidiques avec des modèles bien définis de gouttelettes lipidiques artificielles (ALD) et des monocouches de Langmuir incorporant Plin3. Cela permettra de démêler les interactions spécifiques entre les protéines et Plin3, fournissant ainsi des informations mécaniques utiles pour élaborer de futures stratégies de lutte contre la dengue.

L'étudiant bénéficiera d'une solide collaboration interdisciplinaire avec des partenaires de l'université de Bristol (préparation d'ALD et de liposomes), de l'université de Manchester (synthèse de peptides), de l'institut Jerzy Haber à Cracovie, en Pologne (expression de Plin3), et de l'université de Galway, en Irlande (simulations de dynamique moléculaire).

Pour plus d’informations, veuillez contacter ILL supervisors - Prof. D. Zákutná (D11/SANS, tel.: +33 4 76 20 7394, email: zakutnad@ill.fr), Dr. S. Ayscough (D17/NR, tel.: +33 4 76 20 7480, email: ayscough@ill.fr); University of Bristol - Prof. W. H. Briscoe (tel.: +44 117 455 9119, email: wuge.briscoe@bristol.ac.uk).